UCP3基因在巴马猪和藏猪脂肪组织中的表达和甲基化分析

摘要：

为探究解偶联蛋白3 (uncoupling protein 3,UCP3)基因在巴马猪和藏猪皮下脂肪组织中的表达和甲基化水平,试验采用实时荧光定量PCR技术检测UCP3基因在巴马猪和藏猪皮下脂肪组织中的mRNA表达水平;针对猪UCP3基因启动子区域(-3 580～+920 bp),利用在线软件MethPrimer对该区域进行CpG岛预测,并采用亚硫酸氢盐测序法(bisulfite sequencing PCR,BSP)检测其甲基化水平,探究UCP3基因甲基化水平在巴马猪和藏猪中的差异.结果 显示,巴马猪皮下脂肪组织UCP3基因表达量显著高于藏猪(P＜0.05);在UCP3基因启动子区预测到3个CpG甲基化岛,分别是CpG island1(-3 171～-2 928 bp)、CpG island2(-154～-2 bp)和CpG island3(+648～+806 bp),其中CpG island1和CpG island3的甲基化水平在巴马猪和藏猪中差异较小,而藏猪CpGisland2的甲基化水平(42.61％)高于巴马猪(24.49).本研究绘制了2个猪种CpG island2甲基化水平的黑白点图,其中CpG位点为4、8、9、10、11、12、15,藏猪甲基化频率分别比巴马猪高28.26％、17.39％、26.09％、26.09％、26.09％、23.91％和34.78％.在CpG island2处预测到3个转录因子结合位点(SP2、PPARγ和EGR1).结果 表明,巴马猪和藏猪皮下脂肪组织中UCP3基因mRNA水平的表达差异可能是由于CpG island2的甲基化水平不同所导致,藏猪DNA甲基化水平在一定程度上阻碍了转录因子与启动子调控区域的结合,从而抑制了UCP3基因的表达.

关键词：巴马猪、藏猪、UCP3基因、脂肪组织、甲基化

所属期刊栏目：46

分类号：Q78(基因工程（遗传工程）)

资助基金：国家自然科学基金青年基金;中国农业科学院“青年英才”项目

在线出版日期：2020-01-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：3627-3634