氟苯尼考胁迫下弗氏柠檬酸杆菌转录组测序研究

摘要：

为了探究弗氏柠檬酸杆菌的耐药机制,试验使用氟苯尼考为诱导药物,提取正常培养与400 μg/mL氟苯尼考胁迫下的菌株RNA,利用转录组测序技术对菌株间基因表达水平与差异表达基因进行了分析.结果 显示,每个样品平均产出1.31 Gb数据,与参考基因组的平均比对率为67.01％.对样品间差异表达基因进行检测,共筛选出2 019个显著差异表达基因,其中上调963个,下调1 056个,并发现emrA和emrB 2个基因.KEGG Pathway分析中,富集到代谢途径的显著差异表达基因最多,占全部的72％,碳水化合物代谢、能量代谢、氨基酸代谢、膜转运等通路明显富集.GO功能分析中,生物过程分布的显著差异基因最多,占全部的46％.显著差异表达基因主要涉及到代谢进程、催化活性、结合.本试验结果表明,弗氏柠檬酸杆菌耐药性的产生可能与细胞外排泵介导的主动外排作用、靶位改变、酶的水解作用、细胞膜通透性改变及生物膜的形成有关.

关键词：弗氏柠檬酸杆菌、氟苯尼考、转录组测序、耐药性

所属期刊栏目：46

分类号：S852.61(动物医学（兽医学）)

资助基金：国家自然科学基金31560728;广西科学基金2018GXNSFAA050116

在线出版日期：2019-12-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：3172-3180