牛源IL-6基因克隆与生物信息学分析

摘要：

试验旨在克隆牛白细胞介素-6 (IL-6)基因,并对其编码蛋白进行生物信息学分析,对荷斯坦奶牛进行尾根采血提取RNA后逆转录为cDNA,根据NCBI数据库中已知的牛IL-6基因mRNA序列设计特异性引物,应用RT-PCR技术克隆得到CDS区全长序列,利用生物信息学软件分析牛IL-6基因序列特征、同源性及编码产物的理化性质等.结果 表明,试验成功克隆了牛IL-6基因CDS区,全长627 bp,分子质量为23.759 ku,共编码208个氨基酸,理论等电点为7.58,脂溶系数为93.37,属于亲水性蛋白;牛IL-6基因与猪、绵羊、大鼠、人、猫、犬、鸡、小鼠、马和兔的同源性分别为84.4％、96.2％、66.7％、77.5％、75.9％、79.3％、48.5％、67.0％、79.5％和67.5％;系统进化树分析发现,牛与绵羊亲缘关系最近,猪次之,鸡最远;在二级结构预测中,该蛋白无规则卷曲与α-螺旋分别为34.6％和60.1％;亚细胞定位于细胞质;该蛋白含有信号肽和跨膜螺旋结构.本研究为进一步分析牛IL-6基因的功能奠定了一定的理论基础.

关键词：牛、IL-6基因、克隆、生物信息学分析

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分类号：S858.23(动物医学（兽医学）)

资助基金：河南省基础与前沿技术研究计划152300410095;NSFC-河南人才培养联合基金U1504306;2014年度高层次人才科研启动项目206010615007

在线出版日期：2019-12-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：3163-3171