牦牛MDHⅠ基因多态性及其与生长性状的关联分析

摘要：

本研究旨在探讨牦牛细胞质苹果酸脱氢酶(cytoplasmic malate dehydrogenase,MDHⅠ)基因的遗传多态性及其与生长性状的关联性,以期为牦牛优良性状选育提供参考依据.选取5个牦牛类群(共178头),采集耳组织样提取DNA并构建DNA池,对MDHⅠ基因所有外显子设计特异性引物进行扩增测序,用Mega 5.2筛查SNPs位点,直接测序法鉴定其基因型,利用PopGene 32进行Y2独立性检测、基因纯合度(Ho)、基因杂合度(He)、有效等位基因频率(Ne)和多态信息含量(PIC)分析,利用SPSS 24.0分析MD日Ⅰ基因与牦牛生长性状间的关联性.结果 表明,申扎牦牛、类乌齐牦牛、斯布牦牛、帕里牦牛和麦洼牦牛均在外显子8区域发现1个突变位点(G23093C),属同义突变,有3种基因型:GC、CC和GG,5个牦牛类群中,GC基因型为优势基因型(类乌齐牦牛中GG为优势基因型),G为优势等位基因(斯布牦牛除外),在斯布牦牛中,G和C基因频率相等.x2适应性检验表明,申扎牦牛、类乌齐牦牛、斯布牦牛、帕里牦牛和麦洼牦牛均符合Hardy-Weinberg平衡(F＞0.05).MDHⅠ基因在申扎牦牛、帕里牦牛和斯布牦牛中属于高度多态(PIC＞0.5),在麦洼牦牛和类乌齐牦牛中属于中度多态(0.25＜PIC＜0.5);纯合度最高的是申扎牦牛和类乌齐牦牛.关联性分析结果表明,MDHⅠ基因不同基因型对类乌齐牦牛、帕里牦牛和麦洼牦牛体重有显著性影响(P＜0.05);且种间分析发现,MDHⅠ基因不同基因型对牦牛体重有显著性影响(P＜0.05),说明该基因可作为人工选育的分子标记.

关键词：牦牛、MDHⅠ基因、多态性、生长性状、关联分析

所属期刊栏目：46

分类号：S823.8(家畜)

资助基金：西南民族大学硕士研究生创新课题重点项目CX2018SZ102;国家肉牛牦牛产业技术体系项目CARS-37

在线出版日期：2019-10-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：2658-2664