猪丁型冠状病毒CH/GX/1468B/2017的分离鉴定及全基因组序列分析

摘要：

本研究于广西某猪场采集疑似感染猪丁型冠状病毒(porcine deltacoronavirus,PDCoV)的腹泻仔猪小肠及其内容物进行病毒分离,并通过细胞病变(C PE)、RT-PCR、间接免疫荧光(IFA)和全基因序列测定分析对分离的病毒进行鉴定.结果 显示,试验成功分离到l株PDCoV,命名为CH/GX/1468B /2017(简称PDCoV 1468B).该毒株可稳定有效地在LLC-PK细胞生长增殖,并引起典型CPE;该毒株已在LLC-PK细胞连续传代15代,病毒滴度随着传代次数的增加逐渐提高并稳定在108.10 TCID50/mL以上.该毒株全基因组序列长25 399 nt;与23个GenBank中登录的参考毒株的全基因组序列比对显示,核苷酸同源性为97.2％～99.4％,其中PDCoV 1468B分离毒株与Vietnam/Binh21/2015株同源性最高,为99.4％.全基因组系统进化分析显示,PDCoV 1468B分离毒株属于Ⅱ群,与东南亚国家PDCoV毒株亲缘关系密切,处于同一进化分支.综上所述,本研究成功分离出PDCoV 1468B株并进行了全基因序列分析,为进一步开展PDCoV致病性等生物学特性研究及疫苗研制奠定了基础,同时可为PD-CoV的遗传进化提供数据支持.

关键词：猪丁型冠状病毒(PDCoV)、分离鉴定、全基因组、序列分析

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分类号：S852.65(动物医学（兽医学）)

资助基金：广西创新驱动发展专项资金项目桂科AA17204057;广西自然科学基金项目2017GXNSFBA198092;广西水产畜牧科技项目桂渔牧科201633044、桂渔牧科201633041、桂渔牧科201633034;广西基本科研业务费专项桂科专项17-2;广西兽医生物技术重点实验室开放基金课题16-380-45-B-3

在线出版日期：2019-08-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：1907-1916