哈萨克羊INHβA基因克隆及生物信息学分析

摘要：

试验旨在克隆哈萨克羊抑制素βA(inhibin beta A,INHβA)基因序列,并探究其序列特征及编码蛋白的结构和功能.根据GenBank中绵羊INHβA基因序列(登录号:NM_001009458.1)设计1对特异性引物,通过RT-PCR方法对哈萨克羊INHβA基因进行扩增,将获得的INHβA基因片段插入到pMD19-T载体中进行克隆测序,并结合生物信息学方法预测和分析其核苷酸序列、氨基酸序列、蛋白跨膜、蛋白修饰位点及二级结构、三级结构模型等.结果 显示,哈萨克羊INHβA基因长1 278 bp,编码425个氨基酸.哈萨克羊INHβA基因与绵羊、牛、野猪、小鼠、人、大鼠、猫、兔、马的同源性分别为98.6％、97.7％、90.4％、87.9％、91.1％、88.2％、91.8％、89.8％和91.8％,表明INHβA基因在不同物种之间具有较高的保守性.INHβA蛋白分子式为C2072 H3325 N603 O628 S26,分子质量为47.57 ku,理论等电点(pI)为7.87,不稳定系数为66.16,脂溶指数为78.47,亲水值为-0.507.INHβA是一种碱性不稳定的亲水性脂溶性蛋白,没有跨膜结构,含有信号肽.二级结构预测显示,INHβA蛋白a-螺旋、β-转角、无规则卷曲、延伸链分别占22.59％、4.47％、54.12％和18.82％.三级结构预测显示,INHβA蛋白以α-螺旋为主,是含有8种蛋白修饰位点的β-桶状蛋白.本试验结果为深入研究哈萨克羊INHβA蛋白功能及探讨INHβA基因对提高哈萨克羊繁殖力的影响提供参考数据.

关键词：哈萨克羊、INHβA基因、克隆、序列分析

所属期刊栏目：46

分类号：Q78(基因工程（遗传工程）)

资助基金：兵团国际科技合作项目2016AH001

在线出版日期：2019-08-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：1290-1298