基于SRY基因分析梅花鹿的遗传多样性及父系类型

摘要：

试验旨在研究梅花鹿SRY基因的遗传多样性及其父系类型.选取东北亚种、北海道亚种、本州亚种、指名亚种、屋久岛亚种5个亚种的144个个体,利用试剂盒和传统酚/仿(1:1)法进行DNA的提取,采用PCR扩增和直接测序法分析梅花鹿的核苷酸多样性(Pi)、单倍型多样性(H d)、遗传距离及系统进化关系.结果显示,试验所获序列长度为1613 bp,在第47、62、602、1148、1569、1604 bp处共检测到6个SNPs多态位点,占核苷酸总数的0.3％,碱基替换以碱基转换为主.通过6个SNPs多态位点确立了6种单倍型:Hap-1、Hap-2、Hap-3、Hap-4、Hap-5和Hap-6,其中Hap-4、Hap-5和Hap-6为新发现单倍型.遗传多样性由高至低依次为:指名亚种、屋久岛亚种、东北亚种、本州亚种、北海道亚种.各亚种间遗传距离最小为北海道亚种与本州亚种的距离(0.000056),最大为东北亚种与指名亚种的距离(0.001733).基于单倍型利用邻接法构建系统进化树,结果显示,与日本梅花鹿相比,东北亚种与马鹿关系更近,东北亚种存在两大分支,日本梅花鹿各亚种间无明显分支,其他单倍型均是由Hap-3进化而来,单倍型最小跨度网络图与系统进化树一致.结果表明,东北梅花鹿存在两大父系类型,日本梅花鹿存在一个父系类型,单倍型H ap-3是日本梅花鹿的原始单倍型.

关键词：梅花鹿、SRY基因、遗传多样性、父系类型

所属期刊栏目：46

分类号：S825(家畜)

资助基金：吉林省科技发展计划项目20160307019NY

在线出版日期：2019-04-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：489-496