南宁地区犬细小病毒VP2基因的克隆及遗传进化分析

摘要：

为了解广西南宁地区犬细小病毒(CPV)的流行现状与病毒变异情况,本试验对初步确诊为犬细小病毒病的12份阳性病料提取基因组DNA,以提取的基因组DNA为模板,通过PCR扩增VP2基因序列并测序,将12个阳性毒株样本VP2基因测序结果与GenBank中登录的17株国内外CPV分离株VP2基因进行同源性比对,采用Mega 7.0软件绘制遗传进化树,分析其病毒亚型和遗传进化情况.结果 显示,成功扩增得到12个毒株样本的VP2基因片段,大小约1 755 bp,12株阳性样本毒株的VP2基因同源性在99.2％～100.0％之间,其中NN01与NN07、NN02与NN06同源性最高,为100.0％;阳性样本毒株与国内其他分离株VP2基因的同源性为97.6％～100.0％,其中NN08、NN10及NN04与CPV-ZJ1579同源性最高,均为100.0％,属于CPV-2a亚型;阳性样本毒株与国外代表性毒株同源性在98.1％～99.8％之间.遗传进化树分析表明,12个样本毒株中有3株属于CPV-2a亚型,3株属于CPV-2b亚型,6株属于CPV-2c亚型.这是继2018年初广西分离到CPV-2c型CPV后,首次发现南宁地区大规模流行CPV-2c亚型病毒,预示着CPV-2c亚型CPV在国内的流行正在增加.综上所述,广西南宁地区CPV-2a、CPV-2b与CPV-2c亚型并存,但CPV-2c亚型的比重比其他地区大,这也给该地区提供了新的防治信息,在实际CPV防控工作中除了对CPV-2a、CPV-2b等传统流行亚型的关注之外,更应该重视CPV-2c亚型CPV的防控.

关键词：犬细小病毒(CPV)、CPV-2c、VP2基因、遗传进化分析

所属期刊栏目：45

分类号：S852.69+9.2(动物医学（兽医学）)

资助基金：广西科技厅自然科学基金项目2011GXNSFB018029;广西大学基金项目XB2100019

在线出版日期：2019-04-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：3346-3354