伏牛白山羊TACR1基因扩增及生物信息学分析

摘要：

本研究旨在克隆伏牛白山羊TACR1基因,并对其结构和编码蛋白进行生物信息学分析,为进一步研究TACR1基因的功能及其在生殖生理和免疫调节中的作用奠定基础.根据GenBank中已发表的山羊TACR1基因(登录号:NC_030818.1)序列设计引物,对伏牛白山羊TACR1基因进行分段PCR扩增并测序,拼接后得到包含TACR1基因完整编码区的序列片段.结果表明,伏牛白山羊TACR1基因开放阅读框(ORF)全长852 bp,共编码283个氨基酸,碱基组成为:A(23.47％)、T(25.49％)、C(27.76％)和G(23.27％).与绵羊相比,伏牛白山羊TACR1基因编码区发生了2个碱基突变,但没有引起氨基酸的改变.5’端非编码序列长为860 bp,发生了9个碱基突变;3’端非编码序列长为271 bp,发生了2个碱基突变.同源性分析结果显示,伏牛白山羊与卡普拉山羊、藏羚羊、绵羊、瘤牛、白尾鹿、白鳍豚、人、野猪、金钱豹、土拨鼠、野驴TACR1基因同源性分别为99.9％、99.3％、99.2％、97.5％、96.7％、92.9％、89.7％、88.6％、86.3％、86.2％和85.0％.SignalP 4.1在线软件预测结果显示,TACR1N末端存在信号肽且可能在21位氨基酸处存在裂解位点;蛋白质结构预测发现伏牛白山羊TACR1基因编码蛋白没有跨膜结构域.

关键词：伏牛白山羊、TACR1基因、生物信息学分析

所属期刊栏目：45

分类号：Q785(基因工程（遗传工程）)

资助基金：国家自然科学基金面上项目31472095

在线出版日期：2018-12-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：2409-2416