3个地方猪品种BOLL和STRA8基因结构变异位点的群体分布研究

摘要：

为了探讨BOLL-I6-sv285(15号染色体BOLL基因第6内含子)和STRA8-I4 sv447(18号染色体STRA8基因第4内含子)这两个结构变异在地方猪与欧洲猪品种中的群体分布差异,试验采用PCR方法对从江香猪、江口萝卜猪、荣昌猪和大白猪4个猪品种进行基因分型,并通过在线软件miRBase、UCSC、RegRNA 2.0对结构变异序列所含的功能元件进行分析.结果显示,BOLL I6-sv285为一段285 bp的插入,经群体验证,3个地方猪品种以DI和DD基因型为主,Ⅰ等位基因的频率高于大白猪,插入基因型(Ⅱ)对应较高的产仔数,基因型与从江香猪产仔数之间呈显著相关(P＜0.05);STRA8-I4-sv447为一段447 bp的插入突变,群体中DD基因型占优势,从江香猪、江口萝卜猪和大白猪的Ⅰ等位基因频率高于荣昌猪,插入基因型(Ⅱ)对应较低的产仔数,基因型与从江香猪产仔数之间呈显著相关(P＜0.05).本试验鉴定的BOLL-I6-sv285和STRA8-I4 sv447两个结构变异可作为从江香猪产仔数的候选分子标记.

关键词：BOLL基因、STRA8基因、结构变异、从江香猪、江口萝卜猪、荣昌猪

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分类号：S813.3(普通畜牧学)

资助基金：国家自然科学基金31672390;国家高技术研究发展计划863计划课题2013AA102503;贵州省农业攻关项目黔科合支撑[2017]2585、黔科合支撑[2017]2587;贵州省“百”层次创新型人才项目黔科合人才2016-4012号

在线出版日期：2018-08-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：1599-1607