香猪卵巢RARRES1基因第1外显子CG位点的甲基化及其与基因差异表达的关联

摘要：

为验证和探索香猪卵巢转录组RNA测序检测到的视黄酸受体应答1(retinoic acid receptor responder 1,RARRES1)基因在香猪高、低产仔组之间差异表达的原因,本试验针对RARRES1基因第1外显子ATG下游富含CpG位点区段设计特异性引物,采用亚硫酸氢盐测序法(bisulfite sequencing PCR,BSP)研究卵巢RARRES1基因中的甲基化修饰水平;利用实时荧光定量PCR方法检测高、低产仔组香猪卵巢RARRES1基因的表达量,并探究其与基因甲基化水平之间的相关性.结果表明,与低产仔组相比,香猪高产仔组的甲基化水平较高;4个CpG位点均未被甲基化(CpG_7、CpG_11、CpG_12和CpG_15),另外3个CpG位点(CpG_8、CpG17和CpG_18)基本上全部发生了甲基化.此外,与低产仔组相比,香猪高产仔组中CpG_4(P＞0.05)、CpG_9(P＜0.05)和CpG_16(P＜0.05)位点的甲基化占比较高,而CpG_6位点在香猪低产仔组中的甲基化比例较高,两组差异极显著(P＜0.01).实时荧光定量PCR结果显示,高产仔组香猪RARRES1基因的表达水平较高(P＜0.05).Spearman相关分析结果显示,CpG_9和CpG_16两个位点的甲基化比例与RARRES1基因的表达水平高度正相关(R2 =0.896,P＜0.01),提示这两个位点的甲基化可能是香猪高产仔组RARRES1基因表达量较高的原因.

关键词：香猪、卵巢、RARRES1基因、甲基化、表达量

所属期刊栏目：45

分类号：S828(家畜)

资助基金：国家自然科学基金31672390;国家高技术研究发展计划863计划课题2013AA102503;贵州省农业攻关项目黔科合支撑[2017]2585、黔科合支撑[2017]2587;贵州省“百”层次创新型人才项目黔科合人才2016-4012号

在线出版日期：2018-08-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：1471-1478