金川牦牛BCL2A1基因克隆及生物信息学分析

摘要：

为探讨金川牦牛抗凋亡因子——B淋巴细胞瘤2相关蛋白A1 (B cell lymphoma 2 related A1,BCL2A1)基因特点,本试验采用PCR方法以金川牦牛血液DNA为模板扩增BCL2A1基因,用DNAStar、ExPASy、ABCpred等生物信息学软件分析基因序列和蛋白质结构.结果显示,克隆获得的片段长622 bp,GenBank登录号:MG459158,开放阅读框为516 bp,共编码171个氨基酸,其中缬氨酸(V)、赖氨酸(K)的含量较多,分别为9.4％和8.8％.BCL2A1分子质量为19.46 ku,理论等电点为4.99,不稳定系数为17.44,具有跨膜螺旋结构域(Scores＞500).二级结构主要为α螺旋,占60.82％,有一个BCL2结构域,三级结构模型与人BCL2A1同源性最高(72.79％),BCL2A1存在潜在的B细胞抗原表位.与野牦牛氨基酸序列进行比对显示,金川耗牛BCL2A1存在5个氨基酸差异位点.NJ法系统进化分析显示,金川牦牛与野牦牛同源性为98.5％,亲缘关系最近.本试验成功克隆了金川牦牛BCL2A1基因,其在哺乳动物中具有较高的保守性,为深入研究牦牛BCL2A1基因功能提供理论依据.

关键词：BCL2A1基因、金川牦牛、克隆、蛋白质分析、系统进化分析

所属期刊栏目：45

分类号：S823.8+5(家畜)

资助基金：四川省教育厅重点资助项目16ZA0014;国家民委牦牛创新团队项目13CXTD01

在线出版日期：2018-08-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：1463-1470