家畜全基因组关联分析研究进展

摘要：

全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)是一种研究经济性状候选基因的分析方法.近年来,随着家畜全基因组测序的完成,大量的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)被标识,GWAS也越来越多地应用于家畜重要性状的研究领域中,在动物遗传育种中,通过对家畜基因组进行GWAS分析研究,找到控制家畜主要经济性状的重要SNPs,从而挖掘重要经济性状的候选基因.作者详细综述了GWAS的分析方法及其在重要家畜育种中的研究进展.GWAS分析方法包括基因组控制法(genommic control)、分层分析法(stratification analysis)、主成分分析法(principal components analysis,PAC)和混合线性模型分析法(mixed-linear-model association,MLMA),通路分析方法包括非核算法(基因功能富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)和分层贝叶斯优取(hierarchical Bayes prioritization,HBP))和核算法.依据不同的目标性状选择合理的分析方法,提高GWAS分析结果的准确性,为进一步利用GWAS分析各种性状的遗传基础提供合理的借鉴.

关键词：家畜、全基因组关联分析(GWAS)、统计方法、通路分析

所属期刊栏目：45

分类号：S813.3(普通畜牧学)

资助基金：内蒙古教育厅科学技术处自然科学研究基金项目NJZC14359

在线出版日期：2021-07-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：463-470