猪流行性腹泻病毒CH/GX/2015/750A株的分离鉴定及全基因组序列分析

摘要：

本研究旨在获得可在细胞培养中稳定、有效生长增殖的猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)分离毒株,并对其全基因组序列进行测定分析.应用Vero细胞从广西腹泻仔猪肠道内容物中进行病毒分离,通过细胞病变和RT-PCR对细胞培养物进行鉴定,应用下一代测序技术对分离毒株全基因组序列进行测定.结果显示,成功分离到1株PEDV,命名为CH/GX/2015/750A.该毒株可稳定有效地在Vero细胞生长增殖,并引起典型的细胞病变;已在Vero细胞连续传代25代,病毒滴度随着传代次数的增加逐渐提高并稳定在107.50TCID50/mL.该毒株全基因组序列长28 038 bp;与22个参考毒株的全基因序列比对显示,核苷酸同源性为96.8％～99.8％,其中与YC2014株同源性最高,为99.8％.全基因组和S基因系统进化分析显示,PEDV CH/GX/2015/750A分离毒株属于Ⅱa亚群,与YC2014、PEDV-WS等变异毒株亲缘关系密切.结果表明,本研究分离获得的CH/GX/2015/750A毒株是PEDV地方流行变异毒株.

关键词：猪流行性腹泻病毒(PEDV)、分离鉴定、全基因、序列分析

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分类号：S852.65(动物医学（兽医学）)

资助基金：广西水产畜牧科技项目桂渔牧科201633041、201633044、201633034;广西自然科学基金项目2017GXNSFBA198092;广西基本科研业务费专项桂科专项17-2;广西兽医生物技术重点实验室开放基金课题16-380-45-B-3;广西南宁市西乡塘区科技项目201710317

在线出版日期：2018-07-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：178-188