京海黄鸡G蛋白偶联受体1基因生物信息学及组织表达分析

摘要：

试验旨在研究参与激素调节并调控卵巢功能的可能基因,挑选候选基因G蛋白偶联受体1(G protein-coupled receptor 1),深入研究其是否参与激素调节.根据转录组测序获得的京海黄鸡GPR1基因的CDS序列设计一对引物,利用实时荧光定量RT-PCR方法,检测GPR1基因在高、低产京海黄鸡卵巢组织中的表达情况,并与生物信息学进行关联,使用多种生物软件和在线工具对目的序列进行生物信息学分析,分析GPR1基因与其他物种的同源性、蛋白质的理化性质、蛋白质序列的跨膜区、亚细胞定位、亲水性、潜在的磷酸化位点、保守结构域及该基因所编码蛋白质的二、三级结构.结果显示,京海黄鸡与GenBank中原鸡、人、牛、野猪、黑猩猩、家兔、马、绵羊、藏羚羊、大鼠、小鼠、斑马鱼的同源性分别为100.0％、69.0％、69.1％、69.3％、68.9％、69.6％、69.2％、68.8％、68.9％、67.5％、69.0％和50.3％;氨基酸分析发现GPR1蛋白为疏水性蛋白,分子质量为40.41 ku,理论等电点为6.91,为7次跨膜蛋白;亚细胞定位显示,该蛋白属于非分泌蛋白;预测该蛋白含有25个潜在的磷酸化位点,1糖基化位点;二级结构以无规则卷曲为主,三级结构为7次跨膜螺旋结构;组织表达分析显示,GPR1基因在低产组的表达情况极显著高于高产组(P<0.01).本试验结果将有利于GPR1基因功能的进一步分析,为研究该基因对京海黄鸡产蛋性状的调控机理提供理论依据.

关键词：京海黄鸡、G蛋白偶联受体1、生物信息学分析、蛋白、组织表达

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分类号：S831(家禽)

资助基金：国家肉鸡产业技术体系nycytx-42-G1-05;江苏高校优势学科建设工程;江苏省动物遗传繁育与分子设计重点实验室

在线出版日期：2017-09-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：2215-2225