基于皮肤组织转录组数据研究水牛与黄牛温度适应性的差异

摘要：

为了找到与水牛和黄牛温度适应性差异相关的信号通路,本研究对3头成年水牛和3头成年黄牛的皮肤组织进行了转录组测序和生物信息学分析.结果显示,测序后水牛和黄牛皮肤组织分别得到59 369 167和69 837 009条reads,与参考基因组的唯一比对率分别为70.76%和75.55%.水牛和黄牛皮肤组织共有1 611个差异表达基因,其中801个在水牛皮肤中上调,810个在水牛皮肤中下调.GO分析结果显示,注释到细胞组分、分子功能、生物学过程的差异表达基因分别为316、263和278个.KEGG分析结果显示,差异表达基因共富集在33条信号通路上,其中神经活性配体-受体相互作用、氧化磷酸化、胆碱能突触、5-羟色胺能神经突触、GABA能突触、钙信号通路等信号通路可能与水牛和黄牛在温度适应性上的差异相关.综上所述,突触与氧化磷酸化可能与水牛和黄牛之间的温度适应性差异有关,本研究为进一步了解水牛和黄牛对温度适应性差异的分子机制和分子育种奠定基础.

关键词：转录组、信号通路、差异表达基因、皮肤、水牛、黄牛

所属期刊栏目：44

分类号：Q78(基因工程（遗传工程）)

资助基金：内蒙古自然科学基金2016MS0349;内蒙古高等学校科学研究项目NJZY16067

在线出版日期：2017-08-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：1906-1914