粤北地区新生仔猪腹泻病原学调查及PEDV ORF3基因分子特征和遗传变异分析

摘要：

为了解粤北地区新生仔猪腹泻病的主要病原,本试验采用实时荧光定量RT-PCR方法对2015年粤北地区6个规模化猪场31份新生仔猪腹泻样品进行了猪流行腹泻病毒(PEDV)、猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)和猪轮状病毒(PoRV)检测,并对5株PEDV流行毒株ORF3基因进行测序分析.病原检测结果显示,83.87%(26/31)样品为PEDV阳性,没有检测到TGEV和PoRV阳性样品.对PEDV ORF3基因序列分析结果显示,5个流行毒株ORF3基因全长均为675 bp,相互之间核苷酸同源性为98.7%~100.0%,与参考序列同源性为94.5%~100.0%,多个核苷酸位点发生了共同突变.系统进化树分析结果表明,PEDV可分为两个基因群,粤北地区流行的PEDV与2013-2015年间在中国部分地区、东南亚、北美洲和欧洲流行的PEDV遗传关系较近,位于基因1群中的同一个亚群,而2011-2012年中国流行的PEDV主要毒株及疫苗毒株则归类于另外两个基因亚群.结果表明,粤北地区新生仔猪腹泻主要是由PEDV感染引起的,PEDV基因随着时间推移呈现不断进化和变异趋势.

关键词：新生仔猪腹泻、病原学、猪流行性腹泻病毒、ORF3基因、遗传变异

所属期刊栏目：44

分类号：S858.28(动物医学（兽医学）)

资助基金：广东省科技计划项目2016A040402038、2013B020306008;广东省现代农业科技创新联盟建设项目2016LM1141;韶关市科技计划项目2013CX/N09;韶关学院校级科研项目SY2016KJ24

在线出版日期：2017-08-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：1769-1777