6株猪流行性腹泻病毒贵州株S基因序列分析

摘要：

为了解贵州省猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)S基因的特点,掌握其遗传变异情况,本试验设计3对特异性引物对6株PEDV贵州株S基因进行全基因RT-PCR扩增、克隆及序列测定;应用生物信息学软件将6株PEDV贵州流行株与参考毒株进行同源性与系统进化分析.结果显示,6株PEDV贵州流行株S基因的全基因长为4 161 bp,编码1 387个氨基酸,与国内外PEDV参考毒株核苷酸同源性在93.3%~98.8%之间,氨基酸同源性在91.6%~98.9%之间;进化树分析结果显示,6株流行毒株与美国毒株、越南毒株和山东毒株亲缘关系较近;与CV777株、LZC、Brl、83P-5亲缘关系较远.结果表明,PEDV贵州地方流行毒株S基因编码的氨基酸存在一定程度变化,近年来呈现变异趋势.本研究可为贵州省PEDV的防控提供一定的理论依据.

关键词：猪流行性腹泻、S基因、生物信息学分析

所属期刊栏目：44

分类号：S852.65(动物医学（兽医学）)

资助基金：贵州省科学技术厅农业攻关项目"贵州省仔猪腹泻性疫病风险分析及综合防控技术研究"黔科合NY[2015]3009-1号;贵州省生猪质量安全工程技术研究中心建设项目"生猪健康养殖实验室建设与技术研发"黔科合农C字[2011]4022号;贵州省农业委员会科技计划项"2015年贵州省重大动物疫病省级定点监测"2015-11号

在线出版日期：2017-08-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：1621-1629