山羊BMPR-IB基因编码蛋白结构及功能的生物信息学分析

摘要：

试验旨在利用生物信息学方法分析山羊骨形态发生蛋白受体IB(bone morphogenetic protein receptor IB,BMPR-IB)基因编码蛋白的结构及功能.本研究通过在线软件预测和分析山羊BMPR-IB基因编码蛋白的一级结构、二级结构、亚细胞定位、三级结构、重要的功能基序及其分类,通过最大似然法对不同物种BMPR-IB基因编码蛋白序列构建系统发育树,进行系统发育分析.结果发现,山羊BMPR-IB基因共编码502个氨基酸,其编码蛋白属于不稳定的亲水性蛋白质.二级结构以β折叠为主,比例为63.5％,主要存在于细胞核中,在线粒体、细胞质、囊泡分泌系统和质膜中也有少量分布.该蛋白主要发挥嘌呤和嘧啶、监管、运输和结合、信号转导等功能.在127-149氨基酸位置存在1个跨膜结构域;在174-203、204-494氨基酸位置存在2个高度保守的基序,分别为GS结构域和蛋白激酶结构域.三级结构由sheet片段结构富集域和helix螺旋结构富集域组成.不同物种BMPR-IB基因系统发育分析结果与动物学分类结果一致,提示BMPR-IB基因与繁殖力性状存在联系.通过不同的在线预测软件分析了山羊BMPR-IB基因编码蛋白的结构及功能,为深入研究BMPR-IB基因提供理论指导.

关键词：BMPR-IB基因、山羊、生物信息学、蛋白质结构

所属期刊栏目：44

分类号：Q78(基因工程（遗传工程）)

资助基金：国家现代肉羊产业技术体系项目CARS-39;河北农业大学青年科学基金项目QJ201218

在线出版日期：2017-10-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：1259-1266