不同遗传背景猪群体黏病毒耐药蛋白1基因多态性分析

摘要：

为探讨不同遗传背景猪黏病毒耐药蛋白1(myxovirus resistance, Mx1)基因的遗传多态性,本试验采用RT-PCR方法扩增克隆出猪Mx1基因并进行生物信息学分析,采用高分辨率熔解曲线法(HRM)对民猪、长白山野猪与民猪杂交猪(简称野杂猪)和大白猪3个群体Mx1基因外显子2区多态性进行分析.结果显示,从民猪及野杂猪中成功克隆出4条Mx1基因mRNA序列.该序列含有1个1 992 bp的完整开放阅读框(ORF),编码663个氨基酸.比较发现4条Mx1基因序列中共含有30个SNPs位点,其中17个SNPs位点引起了氨基酸序列的变异.功能结构域分析发现,大部分氨基酸突变位点位于Mx1基因功能结构域两侧.HRM多态性分析显示,Mx1基因外显子2区DD基因型作为优势基因型在3个群体中具有最高的基因型频率,其中大白猪中DD基因型频率为100%,野杂猪为62.5%,民猪为56.2%.基因多态性分析还发现该区域存在更多的核苷酸及氨基酸突变位点,表明民猪和野杂猪Mx1基因存在更丰富的基因多态性.

关键词：黏病毒耐药蛋白1基因、民猪、大白猪、野杂猪、基因多态性

所属期刊栏目：44

分类号：S813.3(普通畜牧学)

资助基金：吉林省重点科技公关项目20140204061NY

在线出版日期：2017-06-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：1046-1053