马身猪MEF2A基因4种可变剪接体的克隆和生物信息学分析

摘要：

本研究旨在克隆马身猪肌细胞增强因子2A(myocyte enhancer factor 2A, MEF2A)基因的不同剪接体类型.依据转录组测序对可变剪接的预测结果,试验扩增MEF2A基因第5~8外显子之间的编码区,用生物信息学软件分析了马身猪MEF2A基因不同剪接体的序列特性,预测保守结构域,构建系统进化树,比对不同物种MEF2A的氨基酸同源性.结果显示,获得了4个MEF2A基因的剪接体,MEF2A1的第5~8外显子正常剪接;MEF2A2缺失了第5外显子,第6外显子的5′端多出138 bp,第7外显子的3′端多出102 bp;MEF2A3缺失了第5外显子,第6外显子的5′端多出138 bp;MEF2A4第7外显子的3′端多出102 bp.插入的138 bp序列编码的蛋白质中存在1个保守结构域HJURP_C,这可能与MEF2A参与肝细胞纤维化作用有关.MEF2A1和MEF2A4与猪MEF2A1 (GenBank登录号:NP_001090890.1)同属于一个亚群,同源性高达98.9%,MEF2A2和MEF2A3与猪MEF2A2 (GenBank登录号:NP_001093168.1)同属于一个亚群,同源性分别为98.2%和98.9%.本试验成功克隆了4个MEF2A基因的剪接体,为进一步研究其蛋白功能奠定基础.

关键词：马身猪、MEF2A基因、可变剪接、生物信息学

所属期刊栏目：44

分类号：Q78(基因工程（遗传工程）)

资助基金：山西省科技创新重点团队项目201605D131045-24;三晋学者项目2016;山西省农业科技攻关项目20140311020-5;山西省高等学校优秀青年学术带头人项目

在线出版日期：2017-06-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：965-972