基于RNA-Seq技术的京海黄鸡卵巢组织转录本预测及新基因挖掘

摘要：

鸡及许多物种的全基因组测序及相关基因图谱都已宣告完成,但由于注释方法的局限性,还存在许多遗漏的新基因及对现有基因的误差注释.RNA-Seq技术是基于第2代测序技术的转录组学研究方法,该研究利用高通量测序技术对8只(高产组4只、低产组4只)300日龄体重一致、饲养条件相同、产蛋数存在差异的京海黄鸡的卵巢组织所有RNA反转录而成的eDNA文库进行测序,通过分析RNA Seq获得的京海黄鸡卵巢组织转录组数据,共发现4 431个新转录本,并将所有新转录本与GO、NR、Swiss-Prot、KEGG数据库进行比对和分析,发现了很多潜在的新基因并进行功能注释,为鸡基因组的进一步完善及功能基因的挖掘提供了数据基础.

关键词：转录组测序、京海黄鸡、新转录本、新基因、功能注释

所属期刊栏目：44

分类号：Q78(基因工程（遗传工程）)

资助基金：国家肉鸡产业技术体系nycytx-42-G1-05;江苏高校优势学科建设工程;江苏省动物遗传繁育与分子设计重点实验室

在线出版日期：2017-05-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：497-504