绵羊痘病毒固原株L2R基因的克隆与生物信息学分析

摘要：

为分析绵羊痘病毒 L2R 蛋白的分子特征，本试验提取了绵羊痘病毒固原株（GY）的基因组 DNA，设计L2R 基因引物，对 L2R 基因进行扩增，将扩增的基因连接到 pGEM-T Easy 载体后转化到大肠杆菌 Trans 5α感受态细胞，筛选阳性克隆，进行序列测序。利用生物信息学软件对 L2R 基因序列进行预测分析。结果显示，L2R 基因序列含有一个由279个核苷酸组成的开放阅读框，编码92个氨基酸残基组成的多肽，蛋白质分子质量理论值为10．92 ku，理论等电点为6．56。该蛋白质二级结构组成分别是α-螺旋占69．57％，β-折叠占9．78％，无规则卷曲占8．70％，延伸链占11．96％。多序列比对分析结果显示，不同羊痘病毒分离株 L2R 序列高度保守。进化树分析结果显示，GY 株与 NK、TU 及 SA 株在一个分支，表明它们之间亲缘关系较近。本试验结果为进一步研究 L2R 蛋白的生物学功能和羊痘病毒早期蛋白的分子相互作用奠定了基础。

关键词：羊痘病毒、L2R基因、基因克隆、生物信息学

所属期刊栏目：44

分类号：S852.65+4(动物医学（兽医学）)

资助基金：国家重点研发计划课题2016YFD0500907；甘肃省国际科技合作专项1604WKCA012；甘肃省国际科技合作专项1504WKCA055

在线出版日期：2017-03-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：201-207