猪MAP3K5基因CDS序列克隆及生物信息学分析

摘要：

试验克隆了猪 MAP 3K 5基因 cDNA 序列，分析了猪 MAP 3K 5基因与 MAP3K 家族及其他物种 MAP 3K 5基因的序列同源性，并研究了其保守结合域。通过 RACE-PCR 扩增获得猪 MAP 3K 5基因5452 bp 的序列，并分析其可能的开放阅读框及预测蛋白序列，获得了 MAP 3K 5基因31个外显子结构。通过比对发现，猪 MAP 3K 5基因与 MAP3K 家族其他成员的 mRNA 及蛋白质序列的同源性较低，均在50%以下，其中猪 MAP 3K 5与 MAP 3K 6基因序列的同源性相对较高；猪 MAP 3K 5基因与其他物种的 MAP 3K 5基因的 mRNA 及蛋白质序列的同源性较高，均在78%以上，其中猪 MAP 3K 5基因与牛、绵羊、犬和人的 MAP 3K 5基因序列的同源性较高。对与猪MAP3K5序列同源性更高的蛋白质进行保守结构域分析，发现 MAP3K6与 MAP3K5的保守域和结合位点类似，其他 MAP3K 家族成员与 MAP3K5的结构域差别较大；而其他物种的 MAP3K5与猪 MAP3K5相比保守结构域和结合位点相似。结果初步表明了猪 MAP3K5序列和结构域特点，可为后续 MAP 3K 5基因的功能研究奠定基础。

关键词：猪、MAP3K5基因、序列比对、结构域

所属期刊栏目：43

分类号：Q78(基因工程（遗传工程）)

资助基金：中国农业科学院科技创新工程ASTIP-IAS02；国家"十二五"科技支撑计划项目2015BAD03B02-2；国家现代农业产业技术体系CARS-36

在线出版日期：2016-11-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：2509-2517