白洗猪PID1基因克隆及序列分析

摘要：

本研究旨在对白洗猪磷酸酪氨酸互作结构域1 (phosphotyrosine interaction domain containing 1,PID1)基因进行克隆和生物信息学分析.采用Nest PCR及T克隆技术对白洗猪PID1基因进行克隆测序,运用生物学分析软件分析其结构功能及其在种内及种间的遗传进化关系.结果表明,白洗猪PID1基因CDS区全长654 bp,编码217个氨基酸,白洗猪与山东莱芜猪、广西陆川猪PID1蛋白氨基酸同源性为98.2％与97.7％;进化树分析结果表明白洗猪与两个猪种间遗传关系相对较远,种间比对黄牛、牦牛、猕猴、小鼠、眼镜王蛇、人、原鸡、非洲爪蟾、大鼠和斑马鱼PID1蛋白氨基酸同源性依次为96.6％、96.6％、96.3％、95.0％、93.9％、91.7％、90.8％0、88.2％、69.7％和67.3％;系统进化树分析表明PID1基因在多物种之间的进化高度保守,结构功能分析表明白洗猪PID1基因功能区主要是编码链氨基酸C端的PTB结构域.本研究成功克隆了白洗猪PID1基因,为探究其对白洗猪肌内脂肪沉积方面的影响及为白洗猪种资源开发利用奠定理论基础.

关键词：白洗猪、肉质、肌内脂肪、PID1基因、克隆、PTB

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分类号：S828(家畜)

资助基金：贵州省农业攻关项目黔科合NY[2013]3071号;贵州省农业攻关项目黔科合NY[2015]3008-1号

在线出版日期：2016-05-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：906-912