绵羊Lin28基因编码区克隆与序列分析

摘要：

为研究绵羊Lin28基因的功能,探讨其在绵羊体细胞重编程中的作用,本研究参照GenBank上小鼠、猪、牛和人的Lin28基因mRNA序列的保守区设计简并引物,Trizol法提取100 d左右胎绵羊肠组织总RNA,RT-PCR扩增Lin28基因编码区(CDS)序列,利用生物信息学软件DNAMAN、BioEdit和在线软件NCBI BLASTn、PlantsP和ScanProsite等分别进行核苷酸和推导的氨基酸序列比对,构建进化树,分析蛋白功能结构域并推测氨基酸序列的三维结构.结果显示,绵羊CDS区为包括终止密码子在内的630 bp,编码209个氨基酸.同源性分析结果表明,其与爪蟾、斑马鱼、鸡、牛、马、猫、猪、人、大鼠和小鼠的核苷酸序列同源性分别为53.8％、55.2％、70.2％、88.3％、88.7％、89.2％、89.5％、90.5％、95.9％和98.9％;氨基酸序列同源性分别为76.5％、67.9％、93.2％、99.3％、97.7％、99.3％、99.3％、98.5％、99.3％和100.0％.生物信息学分析显示,绵羊Lin28蛋白含有2个CCHC型的锌指结构和1个冷休克结构域.结果表明,本试验成功克隆Lin28基因的编码区,为进一步研究Lin28基因的功能及探讨其在绵羊体细胞重编程中的作用奠定基础.

关键词：绵羊、Lin28、序列分析

所属期刊栏目：42

分类号：Q78(基因工程（遗传工程）)

资助基金：东北林业大学大学生创新训练项目201410225103;国家自然科学基金资助项目31000990

在线出版日期：2016-05-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：2567-2572