2011年-2014年广西猪流行性腹泻病毒检测及其M基因的序列分析

摘要：

本试验应用RT-PCR方法对2011年1月-2014年4月采自广西南宁、玉林等14个地区的331份仔猪腹泻粪便样品进行猪流行性腹泻病毒(PEDV)检测.结果显示331份样品中有210份为PEDV阳性,阳性率为63.44％.对其中25份阳性样品的PEDV M基因进行克隆和测序,将测序结果与GenBank中PEDV参考毒株的M基因序列进行同源性比对分析并构建系统进化树.25个PEDV M基因序列与51个参考毒株M基因的核苷酸和氨基酸同源性分别为96.0％～99.9％、94.3％～99.6％.PEDV M基因遗传变异分析结果表明,广西2013年-2014年的PEDV流行毒株与北京、安徽、武汉、河北、广东等地2010年-2013年的流行毒株亲缘关系较近,而与中国早期分离株CH/S(GenBank登录号:JN547228)、疫苗株CV777(GenBank登录号:AF353511)和AttenuatedDR13(GenBank登录号:JQ023162)的遗传距离较远.提示广西现流行的PEDV与早期毒株相比已发生较为明显的变异.

关键词：猪流行性腹泻病毒(PEDV)、M基因、遗传变异

所属期刊栏目：42

分类号：Q78(基因工程（遗传工程）)

资助基金：广西水产畜牧兽医局科研项目桂渔牧科12049031;广西畜禽疫苗新技术重点实验室系统性研究课题12-071-28-A-5;广西基本科研业务费专项桂科专项14-2

在线出版日期：2016-05-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：549-557