京海黄鸡γ-干扰素水平的全基因组关联分析

摘要：

试验旨在寻找影响京海黄鸡γ-干扰素(IFN-γ)水平的分子标记.本研究以京海黄鸡核心群母鸡为基础,测定了血清中INF-γ的浓度,利用简化基因组测序技术进行全基因组关联分析(GWAS),检测与INF-γ浓度相关的SNPs位点.结果共检测到1个在基因组水平上与其潜在显著相关的SNP位点,并达到染色体显著水平.该SNP位于2号染色体上MYOM1基因内部.使用GO数据库对该基因的细胞组分、分子功能和参与的生物进程进行分析,由结果推断MYOM1基因可能为影响京海黄鸡细胞因子INF γ水平的重要候选基因.

关键词：简化基因组测序、京海黄鸡、INF-γ、全基因组关联分析

所属期刊栏目：42

分类号：Q78(基因工程（遗传工程）)

资助基金：国家肉鸡产业技术体系nycytx-42-G1-05;江苏高校优势学科建设工程;江苏省动物遗传繁育与分子设计重点实验室

在线出版日期：2016-05-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：245-250