猪细小病毒疫苗株NS1基因克隆及生物信息学分析
为进一步开展猪细小病毒(porcine parvovirus,PPV) NS1蛋白功能研究,根据GenBank登录的PPV参考株NADL-2(登录号:NC001718)的NS1基因序列设计1对特异性引物,采用PCR技术扩增PPV疫苗株NS1基因,将PCR扩增产物克隆入pTA2载体构建重组质粒pTA2-NS1,并进行测序鉴定.测序结果显示,构建的pTA2-NS1质粒含有一个开放阅读框(ORF),全长1989 bp,共编码662个氨基酸,与GenBank登录的PPV参考株NADL-2、Kresse株的NS1基因的核苷酸同源性分别为99.85％和99.65％,氨基酸同源性分别为99.70％和99.70％.上述结果表明试验成功构建了含有PPV NS1基因的重组质粒pTA2 NS1.应用DNAStar软件及在线ProtScale、SignalP 4.1、TMHMM、Scansite、PSORTⅡ等生物信息学软件对NS1基因及其编码蛋白进行生物信息学分析,结果显示NS1蛋白分子质量为75.7 ku,等电点PI为6.82,是弱酸性蛋白;NS1蛋白不含信号肽序列,无跨膜区,为可溶性蛋白,主要定位于细胞核内,T199、Y309、T338、T512、S631、T635为其潜在磷酸化位点.以上研究为进行PPV NS1蛋白表达,进一步开展NS1蛋白功能研究奠定了基础.
猪细小病毒、NS1基因、生物信息学分析
41
S852.65(动物医学（兽医学）)
四川省畜牧科学研究院基本科研项目SASA2013B04;四川生猪现代化产业技术体系疫病控制岗位;四川省财政基础科研经费专项生猪重大疫病免疫技术研究
2016-05-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共6页
21-26
