新城疫病毒西藏分离株HN基因克隆与序列分析

摘要：

为确定西藏新城疫病毒(Newcastle disease virus,NDV)分离株HN基因结构特征及其与已知毒株的遗传相关性,本试验应用RT-PCR技术对西藏NDV分离株HN基因进行扩增,然后克隆至pMD18-T载体测序,并与国内外代表性毒株和当前疫苗株进行比对及系统发育分析.结果表明,NDV分离株HN基因片段长度为1734 bp,编码577个氨基酸;推导的氨基酸序列均有5个糖基化位点,XZ10和XZ17有12个半胱氨酸残基,XZ20只有11个半胱氨酸残基.NDV西藏分离株HN基因与国内代表性毒株核苷酸同源性在81.1％～93.0％之间,氨基酸同源性在81.1％～93.6％之间;与疫苗株核苷酸同源性在87.8％～98.7％之间,氨基酸同源性在88.0％～98.9％之间.系统进化分析结果表明,NDV西藏分离株HN基因均属于Ⅱ型.

关键词：新城疫病毒、HN基因、序列分析

所属期刊栏目：40

分类号：Q785(基因工程（遗传工程）)

资助基金：自治区级临床兽医学重点实验室

在线出版日期：2016-05-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：81-85