海南黑山羊小分子热休克蛋白9cDNA克隆及其生物信息学分析

摘要：

本研究以海南黑山羊睾丸组织为材料,利用RT-PCR和RACE技术获得海南黑山羊小分子热休克蛋白9(smallheat shock protein 9,Hspb9)基因完整的CDS序列,并对其进行生物信息学分析.结果表明,克隆得到山羊Hspb9 cDNA长549 bp,CDS区471 bp,共编码157个氨基酸,提交至GenBank数据库中,登录号为:JX088726.生物信息学分析结果表明,Hspb9编码的蛋白无跨膜区和信号肽,存在多个磷酸化位点;预测Hspb9蛋白二级结构α-螺旋占15.28％,β-折叠占30.57％,无规则卷曲占54.15％;存在1个UBQ结构域;Clustel W方法比对山羊Hspb9与绵羊、牛的同源性最高.

关键词：小分子热休克蛋白9、海南黑山羊、cDNA克隆、生物信息学分析

所属期刊栏目：40

分类号：Q785(基因工程（遗传工程）)

资助基金：中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所1630032012022

在线出版日期：2016-05-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：56-60