牦牛病毒性腹泻病毒全基因测序及生物信息学分析

摘要：

从牦牛(Yak)体内分离出牛病毒性腹泻/黏膜病病毒(BVDV MDV),参考GenBank中已收录的BVDV-Ⅰ型的全基因组序列,设计了19对引物,通过RT PCR方法,对牛病毒性腹泻病毒牦牛株进行克隆及测序,得到其全基因组序列(GenBank登录号:JQ799141),序列全长12214 nt,其中5’-UTR长288 nt,3'-UTR长232 nt.将牦牛株BVDV全基因序列与GenBank中登录的其他8株BVDV病毒全基因序列进行同源性比对及系统进化分析,结果表明,牦牛株BVDV与BVDV-Ⅰ型毒株出于同一分支.但与其他8株BVDV毒株全基因序列同源性均不高,有可能属于新的独立基因型或基因亚型,仍需进一步研究证实.

关键词：牦牛病毒性腹泻病毒、全基因序列分析、生物信息学分析

所属期刊栏目：40

分类号：Q78(基因工程（遗传工程）)

资助基金：四川省科技厅攻关项目04JY029-006-04;国家民委项目07XN03

在线出版日期：2013-06-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：33-38