13个物种BPI基因编码区生物信息学分析

摘要：

本研究采用生物信息学的方法比较不同物种BPI基因编码区CDS序列,分析人、小家鼠、褐家鼠、牛、白颊长臂猿、原鸡、家兔、野猪、猕猴、家马、非洲爪蟾、毛猩猩、犬13个物种BPI基因编码区的遗传多样性,且对BPI氨基酸序列组成、信号肽、疏水性/亲水性、跨膜结构、二级结构及保守结构域进行预测分析.结果表明,在13个物种的29条BPI基因CDS序列中,共检测到532个多态位点,生成了15种单倍型,BPI基因在种群间及种群内均存在较大的遗传变异,BPI基因具有较强的密码子偏爱性.BPI蛋白理论等电点均大于7,呈碱性,N端大都有信号肽,肽链表现为亲水性,基本属于跨膜蛋白和分泌蛋白.BPI蛋白主要二级结构元件为a螺旋、β折叠和无规则卷曲,有2个保守结构域BPI1和BPI2.

关键词：BPI基因、编码区、生物信息学

所属期刊栏目：40

分类号：Q753(分子遗传学)

资助基金：教育部高等学校博士学科点专项科研基金20103250120006;苏州市科技支撑计划SN201013;扬州市科技攻关项目YZ2011048

在线出版日期：2013-06-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：28-32