3种冠环线虫rDNA-ITS的PCR扩增及序列分析

摘要：

本试验利用PCR扩增3种冠环线虫5个样品的核糖体DNA内转录间隔区(ITS)及5.8S片段,将PCR扩增产物纯化后直接进行序列测定和分析.序列比对和分析结果显示,所测样品ITS1-5.8S-ITS2的长度范围为748～843 bp,总变异位点(包括gaps)119个,简约信息位点18个；其中ITS1和ITS2的长度范围分别为367～370 bp和228～320 bp,变异位点分别为14个和105个,简约信息位点均为9个.所有测试样品的5.8S片段完全相同,长度为153 bp.5条序列ITS1区的G+C 含量(48.0％～48.5％)明显高于ITS2区(37.7％～40.3％).通过序列两两比对,3种冠环线虫ITS1和ITS2的种间差异性分别为1.9％～3.5％和5.6％～31.8％；而种内差异性分别为0～0.5％和0～0.9％.并且所测序列与GenBank中已知序列的同源性为99.07％～99.41％.本研究认为,ITS序列可以作为冠环线虫种类鉴定的分子标记.

关键词：冠环线虫、内转录间隔区(ITS)、PCR、序列分析

所属期刊栏目：39

分类号：Q78(基因工程（遗传工程）)

资助基金：河南省科技攻关项目102102110142,112102110032;河南省基础与前沿项目102300410103;河南省动物学省级重点学科经费豫教财[2001]160号

在线出版日期：2012-12-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：33-37