高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒山西分离株的鉴定及部分Nsp2基因序列分析

摘要：

本研究采集山西省不同地区的发病猪脏器组织与血液样品,采用特异性RT-PCR方法检测高致病性猪繁殖与呼吸综合征(porcine reproductive and respiratory syndrome,PRRS)样品16份,应用设计的特异性引物扩增出Nsp2基因序列,利用DNAStar生物信息学分析软件,对获得的序列与国外代表毒株VR-2332、国内代表毒株CH-Ia、BJ-4、HB-I及PRRSV变异毒株HuN4和JXA1的序列进行了比较,绘制系统发生树.氨基酸序列比较分析发现山西省流行毒株同源性分别在69.8％～71.7％、85.3％～87.9％、68.7％～70.6％、91.7％～94.3％、94.3％～98.5％、95.1％～98.9％.所获得的16株病毒之间的同源性在90.9％～100％之间.研究结果发现所获得的序列同源性与国内近几年流行的PRRSV的变异毒株HuN4和JXA1毒株的序列同源性最高,分别在94.3％～98.5％与95.1％～98.9％之间,Nsp2基因缺失位置一致,其Nsp2均有2个部位出现了缺失,即Nsp2基因分别为编码1个氨基酸的3个核苷酸的缺失和编码29个氨基酸的连续87个核苷酸的缺失,结果表明,山西省目前流行PRRSV的变异毒株与国内流行株属于同一分支.

关键词：高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒、分离与鉴定、Nsp2基因、序列分析

所属期刊栏目：39

分类号：Q78(基因工程（遗传工程）)

资助基金：山西省科技攻关项目20090311034

在线出版日期：2012-11-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：47-52