水牛TLR4cDNA全长的克隆及其生物信息学分析

摘要：

本研究利用RT-PCR方法分段克隆水牛TLR4 cDNA后拼接成全长,并克隆于pMD20-T载体中,同时运用生物信息学软件对其核苷酸序列及编码蛋白质的结构进行分析和预测.结果表明,克隆的TLR4 cDNA ORF全长2526 bp,共编码841个氨基酸,N端具有由25个氨基酸组成的信号肽,该蛋白预测的分子质量为95.98 ku,等电点为6.37;水牛TLR4与GenBank中登录的水牛TLR4(DQ857349)核苷酸序列同源性达99.01％,与黄牛、绵羊、野猪、马、人和黑猩猩的同源性超过80％,与小鼠和狗的同源性次之,分别为72.17％和61.30％,与鸡的最低,仅为53.94％;该蛋白是由胞外区(1-634位氨基酸)、跨膜区(635-657位氨基酸)和胞内区(658-841位氨基酸)3部分构成的跨膜蛋白,胞外区含有12个LRR串联重复结构域、胞内区具有TIR结构域.本试验成功克隆了水牛TLR4 cDNA全长,并获得了核苷酸及其蛋白质的生物信息学分析数据,为进一步研究其功能奠定了基础.

关键词：水牛、TLR4、cDNA、克隆、生物信息学分析

所属期刊栏目：38

分类号：Q78(基因工程（遗传工程）)

资助基金：国家转基因生物新品种培育重大专项2009ZX08007-009B

在线出版日期：2011-12-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：108-114