猫杯状病毒全基因组的克隆及序列分析

摘要：

采用RT-PCR和重组PCR扩增了猫杯状病毒(feline calicivirus,FCV)CH-GD株的全基因,并进行了序列测定,用DNAStar软件对其核苷酸序列和氨基酸序列进行比较分析.结果表明,首次分离于中国广东的CH-GD株与各参考毒株有较大的差异.CH-GD株与各参考毒株之间的同源性仅为75.4%～77.1%,明显低于各参考毒株之间的同源性(78.9%～99.9%).同时遗传进化树显示,14个分离株形成两大分支,CH-GD株独自在一分支,各分离株无明显的地域性差异.对FCV衣壳蛋白6个区(A～F)的分析结果发现,CH-GD株中A～F区的特点与报道的相符.此外还发现,CH-GD株有3个区域的3个连续的氨基酸发生了变异,与参考毒株相比,CH-GD株在这3个区域的抗原性和亲水性也都发生了相应的变化.

关键词：猫杯状病毒、全基因组、克隆、序列分析

所属期刊栏目：37

分类号：Q78(基因工程（遗传工程）)

资助基金：广东省自然科学基金项目8151064001000004;广东省农业攻关项目2007A020300005-7;广东省农业攻关重点项目2006A20301006

在线出版日期：2010-05-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共3页

页码：109-111