综合分析m6A RNA甲基化调节因子与肺癌免疫浸润及预后的相关性

摘要：

目的 初步探究N6甲基化腺苷(N6-methyl-adenosine,m6A)甲基化调节因子在肺癌肿瘤免疫微环境中的潜在作用及机制.方法 基于TCGA数据库,本研究利用生物信息学综合分析m6A RNA甲基化调节因子与肺癌免疫浸润及预后的相关性.结果 多个m6A RNA甲基化调节因子在肺鳞癌和肺腺癌中差异性表达.然而,ALKBH5仅在肺鳞癌中显著高表达,METTL3和YTHDF3仅在肺腺癌中显著高表达,HNRNPA2B1与肺鳞癌YTHDC1、肺腺癌RBM15表达相关.通过对18个m6A甲基化调节因子的一致性聚类,发现肺鳞癌不同亚型的总生存率无统计学差异.在肺腺癌中,PD-1、PD-L1表达在癌及癌旁组织中无显著差异,且与m6A甲基化调节因子无明显相关性.聚类分析后发现m6A甲基化调节因子在肺腺癌肿瘤免疫微环境中起重要作用,其中Cluster 2组PD-L1表达下降、免疫细胞浸润较高,但是生存期较Cluster 1组延长.Cluster 2组与树突细胞静息、肥大细胞静息、γδ T细胞浸润更相关.Cluster 1组生存期短可能与G2M检查点、E2F通路、MYC通路、MTORC1通路、Wnt/beta-catenin通路,以及树突状细胞激活、巨噬细胞M1、滤泡T辅助细胞浸润水平较高有关.单因素Cox分析结果表明4个甲基化结合蛋白与预后相关,其中IGF2BP3、HNRNPA2B1和IGF2BP2为危险因子,YTHDF2为保护因子.结论 m6ARNA甲基化调节因子与肺腺癌免疫浸润及预后有密切相关性.

关键词：N6甲基化腺苷;肺鳞癌;肺腺癌;免疫浸润;免疫微环境

所属期刊栏目：38

分类号：R966(药理学)

资助基金：浙江省自然科学基金;浙江省省部共建项目;浙江省康恩贝医院管理软科学研究计划

在线出版日期：2021-12-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：2721-2729