缺氧微环境对多发性骨髓瘤转录组和预后的影响及其治疗策略研究

摘要：

目的 利用生物信息学的方法分析肿瘤缺氧微环境对多发性骨髓瘤(multiple myeloma,MM)转录组的影响,筛选差异基因,为探索细胞耐受缺氧环境的分子机制提供信息.方法 从GEO数据库获得缺氧培养下的MM细胞株以及患者骨髓来源CD38阳性细胞的表达谱芯片,利用Limma包分析缺氧环境下一致性较好的差异基因,对这些差异基因进行GO和KEGG分析,并用TCGA数据库研究其表达水平与MM患者生存的关系.最后利用差异基因预测抑制缺氧微环境的潜在药物.结果 针对2种数据集共筛选得到28个一致性较好的差异基因,这些基因主要参与细胞代谢途径、线粒体结构、自噬等,这可能与MM的缺氧耐受有关.生存分析显示:ANXA1、CLU、DPYSL3、CEP128、DDIT4、HMGCS1基因的高表达导致MM患者预后变差.CMAP分析提示PARP抑制剂可抑制缺氧相关信号通路.结论 本研究利用生物信息学手段筛选得到了缺氧影响MM的差异基因,发现其中部分基因的高表达可导致MM患者预后变差,这可能与缺氧环境导致肿瘤细胞生存增强有关.PARP抑制剂可能成为缺氧抑制剂,与其他化疗药物联合使用实现更好的治疗效果.

关键词：多发性骨髓瘤、缺氧、肿瘤微环境、转录组、生物信息学

所属期刊栏目：38

分类号：R966(药理学)

资助基金：浙江省科技计划;浙江省自然基金项目;浙江省中医药科技计划;浙江省医药卫生科技计划;浙江省药学会医院药学专项科研项目

在线出版日期：2021-03-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：148-155