基于高通量测序的青叶胆转录组研究

摘要：

目的 探讨青叶胆中獐牙菜苦苷生物合成的遗传基础.方法 采用Illumina Hiseq 2500高通量测序技术,对青叶胆全草进行转录组测序.结果 共获得68 643个unigene,平均长度901 bp,共有42 954条unigene注释到NR,SwissProt,COG,KOG,GO,Pfam数据库中,獐牙菜苦苷生物合成的3个阶段中,有43条unigene参与中间体的生成,3条unigene参与萜类骨架合成,25条unigene可能参与萜类最后的修饰.结论 首次对青叶胆转录组进行测序分析,获得了可能参与獐牙菜苦苷生物合成的候选基因,为后续功能基因的挖掘奠定了基础.

关键词：青叶胆、转录组、Illumina Hiseq 2500、獐牙菜苦苷

所属期刊栏目：35

分类号：R915(药物基础科学)

资助基金：国家自然科学基金;云南省科技计划

在线出版日期：2018-05-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：363-369