霍乱弧菌H2C全基因组测序及序列分析

摘要：

目的 了解霍乱弧菌产毒株的基因序列,为霍乱基因组学研究提供资料,对可能发生的公共卫生突发事件提供保障.方法 利用Illumina Hiseq测序平台对1株霍乱弧菌(Vibrio cholerae)H2C进行了全基因组测序,对基因组进行组装、基因预测和功能注释.结果 H2C基因组大小为4.09 Mb,GC含量为47.34％,预测编码基因3 642个.在H2C基因组中注释到3 252个基因具有直系同源蛋白簇分类,共查到111个tRNA和9个rRNA基因.与代谢通路相关基因2 366个,与毒力相关基因417个.通过KEGG定位到RTX、CTX和TCP毒力相关基因簇.结论 霍乱弧菌H2C携带多种毒力相关基因,对该菌致病性及环境适应性起到关键作用.

关键词：霍乱弧菌、全基因组测序、基因功能、毒力基因

所属期刊栏目：32

分类号：R446.5(诊断学)

资助基金：厦门市重点专科建设项目

在线出版日期：2022-10-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：1807-1810