非酒精性脂肪性肝炎相关肝癌基因表达谱芯片分析

摘要：

目的 研究非酒精性脂肪性肝炎转变成肝癌(NASH-HCC)中的关键差异表达基因.方法 选择4对NASH-HCC和癌旁石蜡组织进行Affymetric芯片表达谱检测,生物信息学技术筛选差异表达基因,利用DAVID数据库对差异表达基因进行GO功能和KEOG信号通路分析,应用STRING数据库对差异表达基因进行蛋白-蛋白互作网络分析,应用Cytoscape软件筛选核心基因.结果 NASH-HCC癌与癌旁组织中共筛选到279个差异表达基因,GO功能富集分析发现这些差异表达基因显著富集到脂肪代谢、糖脂生物合成、脂肪酸水解及细胞凋亡等相关的功能,KEGG通路富集分析表明差异表达的基因显著与脂肪酸合成与代谢、病毒感染及有机物代谢等通路相关.蛋白相互作用因子调控网络分析发现多能干性基因(c-Myc、Oct-4、KLF-4和Nanog)和形态分化基因(Gli-1)在人NASH-HCC标本中高表达,且在PPI中处中心位置,与其他差异表达基因存在广泛的蛋白互作关系.结论 多能干性基因和形态分化基因可能在NASH-HCC病变过程中发挥至关重要的作用.

关键词：非酒精性脂肪性肝炎相关肝癌;基因芯片;多能干性基因;形态分化基因

所属期刊栏目：31

分类号：R735.7(肿瘤学)

资助基金：中国博士后科学基金面上项目;浙江省科研项目

在线出版日期：2022-01-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：2817-2820