基于RNA测序探索复发性流产生物标志物的研究

摘要：

目的 分析复发性流产(recurrent spontaneous abortion,RSA)患者生物信息,探讨差异表达基因作为生物标志物的价值.方法 使用R语言分析RSA患者流产物测序数据,筛选差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),使用GSEA对DEGs注释,使用STRING分析DEGs编码蛋白间的相互关系(protein protein interaction,PPI),并筛选出候选基因.选取16例RSA患者(实验组)与16例人工流产患者(对照组)流产物绒毛组织,利用实时荧光定量PCR(real-time fluorescent quantitative PCR,qRT-PCR)验证候选基因.结果 共筛选255个DEGs,其中低表达基因219个,高表达36个.17个基因为可能的候选基因.经验证,实验组IL8、CCL20、CXCL9表达低于对照组,差异有统计学意义(P＜0.01),实验组AFP高于对照组,差异有统计学意义(P＜0.01).结论 IL8、CCL20、CXCL9、AFP基因可能在RSA病理过程中起重要作用.

关键词：复发性流产;差异表达基因;实时荧光定量PCR

所属期刊栏目：31

分类号：R714.21(妇产科学)

资助基金：安阳市重点研发与推广专项;河南省医学科技攻关计划

在线出版日期：2021-06-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：1093-1095,1112