基于Ion Torrent S5平台的二代测序技术对HLA-DRB1基因分型模棱两可进行分析

摘要：

目的 基于Ion Torrent S5平台NGS法进行HLA-DRB1基因分型检测的模棱两可结果的种类、比例进行分析.方法 对471例脐带血造血干细胞库标本采用基于Ion Torrent S5平台的二代测序法检测HL4-DRB1位点,并同步对其中的94例标本采用PCR-SBT测定HL4-DRBI位点,余下377例标本采用PCR-SSO流式磁珠法检测.使用分型软件指定NGS法的HL4-DRBl分型结果,以HL4-DRBl*后第三区的数字作为高分辨水平统计,直接计算法分析模棱两可组合比例.结果 标本中470例HL4-DRBI基因NGS检测结果与PCR-SBT法或PCR-SSO法相符合;其中1例标本NGS法漏检一个等位基因,符合率为99.8％.NGS法检测结果中,471例标本中有160例标本HL4-DRBI等位基因型出现模棱两可,比例为33.97％(160/471).最常见的模棱两可结果组合为DRB1 * 09 ∶ 01 ∶ 02/09 ∶ 21.结论 基于Ion Torrent S5平台的NGS技术可降低HL4-DRBl基因分型的模棱两可结果比例,但仍有一定比例的模棱两可组合结果,同时应注意NGS法检测漏检等位基因的风险.

关键词：二代测序法、HLA-DRB1、模棱两可、测序分型

所属期刊栏目：31

分类号：R617(外科手术学)

资助基金：浙江省科技厅公益技术应用研究;浙江省医药卫生资助计划

在线出版日期：2021-03-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：195-198