应用下一代测序技术进行HLA-A、HLA-B基因分型的模棱两可结果情况分析
目的 统计分析NGS法进行HLA-A、HLA-B基因分型检测的模棱两可结果的种类、比例.方法 对369例浙江省脐带血库标本采用NGS法检测HLA-A、HLA-B位点,并同步对其中94例标本采用PCR-SBT测序法测定HLA-A、HLA-B位点,余下275例标本采用PCR-SSO流式磁珠法检测.使用专业软件指定NGS法的HLA-A、HLA-B分型结果,直接计算法分析模棱两可组合比例.结果 所有标本NGS法检测结果与PCR-SBT法或PCR-SSO法相符合,未发现NGS法遗漏等位基因情况.NGS法以HLA-A、HLA-B命名*后第四区域的数字作为高分辨水平统计,369例有34例标本出现模棱两可结果,占9.21%(34/369),其中只有2例标本HLA-A、HLA-B位点同时存在模棱两可结果.HLA-A位点有9例标本存在模棱两可结果,表现出8种类型;HLA-B位点有27例,25种类型,分别占标本总数的2.44%(9/369)、7.32%(27/369).结论 应用NGS技术仍有少量HLA-A、HLA-B基因分型的模棱两可组合结果.
下一代测序法、HLA-Ⅰ类基因、模棱两可、测序分析
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R450(治疗学)
浙江省科技厅公益技术应用研究2017C33121;浙江省医药卫生平台重点资助计划2015ZDA012
2019-10-10(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
共5页
1924-1927,1931