肺腺癌患者外周血环状RNA差异表达谱研究

摘要：

目的 筛选肺腺癌患者外周血中差异表达的环状RNA(circular RNA,circRNA),并进行生物信息学分析,以探讨外周血circRNA在肺腺癌发病中的作用.方法 采用Illumina公司Solexa高通量测序对5例肺腺癌患者和5例健康对照者的外周血中的circRNA进行筛查,用R软件包对数据进行归一化及后续数据处理,通过log2foldchange和P值进行筛选,采用t检验,寻找2组样本间差异表达的circRNA,并对差异表达的circRNA进行生物信息学分析.结果 高通量测序筛查结果提示,有4 390个circRNA在肺腺癌组和对照组之间差异有统计学意义(P＜0.05),3 009个circRNA上调,1381个circRNA下调.对这些circRNAs所涉及的基因进行基因本体论(GO)分析,结果显示,这些基因主要参与生物学调控、细胞分化、代谢过程等.对每个差异表达的circRNA的靶miRNA进行预测.结论 肺腺癌患者外周血中出现许多差异表达的circRNA,circRNA可能参与肺腺癌的调控机制.

关键词：肺腺癌、生物信息学、环状RNA、表达谱

所属期刊栏目：29

分类号：R733(肿瘤学)

资助基金：浙江省医药卫生科技项目2019KY606

在线出版日期：2019-01-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：211-214