杭州市2013年-2014年甲型H3N2流感病毒PA基因的进化分析

摘要：

目的 分析2013年-2014年杭州市甲型H3 N2流感病毒PA基因及其编码蛋白的特征,揭示其分子特征与演化趋势.方法 对76株H3N2流感病毒PA基因进行扩增和测序,采用序列多重比对、突变位点比较分析、选择压力分析、系统发育分析等方法进行遗传进化分析.结果 76株流感病毒PA基因的核苷酸序列、编码蛋白序列及PA-X蛋白序列一致性分别为98.28％ ～ 100.00％、98.46％ ～ i00.00％和98.41％ ～ 100.00％;PA蛋白以及PA-X蛋白的氨基酸序列与参考株A/Ohio/2/2012相比,分别有15个位点和2个位点发生了显著的氨基酸突变;筛选到321、432共2个正向选择压力位点;构建系统进化树发现PA基因分2个支系,支系Ⅱ有2个分支,第3个流行高峰集中在分支ⅡC上.结论 杭州市2013年-2014年甲型H3N2流感病毒PA基因呈现出2个不同支系,编码蛋白的部分氨基酸位点发生了突变,个别位点具有正向选择压力,可能与病毒的复制能力和致病性的改变相关.

关键词：甲型H3N2流感病毒、PA亚基、PA-X蛋白、进化分析

所属期刊栏目：27

分类号：R373.1+3(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

在线出版日期：2017-07-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：1600-1604