广州与佛山地区2014年登革病毒基因型特征研究

摘要：

目的 对2014年广州与佛山地区登革病毒C-prM区进行基因测序,从分子水平与相关国际流行株进行同源性比较,构建系统发育树,追踪其可能输入来源.方法 收集本院2014年9月-11月447例登革热疑似患者急性期血清,随机选取其中广州与佛山地区不同区域的24例标本,提取病毒RNA,RT-PCR法扩增C-prM基因,并将其克隆到pMD19T载体,测序并利用生物信息学软件进行分析.结果 成功测序登革病毒11株,BLAST分析表明均为登革1型病毒(DENV-1).系统发育树结果显示GZ2014-01等序列与2010年印度德里流行株同源性高(相似度为99.21％),GZ2014-02等序列与2013年广州流行株相近(相似度为97.64％ ～ 98.82％).广州株GZ2014-01等和佛山株GZ2014-23属于基因型Ⅴ,而广州株GZ2014-02等和佛山株GZ2014-20属于基因型Ⅰ.结论 GZ2014-01等株可能来源于印度德里,而GZ2014-02等株可能来源于中国广州.登革病毒多基因型流行可能是造成2014年登革热大暴发的原因之一.

关键词：登革病毒、C-prM基因、系统发育树、基因分型

所属期刊栏目：26

分类号：R373.33(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：全军医学科技科研项目十二五;广州市科技计划;广东省科技计划

在线出版日期：2016-06-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：1219-1222