仙居县80株结核分枝杆菌临床分离株VNTR基因分型研究

摘要：

目的 了解仙居县结核分枝杆菌临床分离株不同基因型的分布情况,探讨该县结核病分子流行病学特征.方法 收集2011年4月-2012年3月仙居县分离的80株结核分枝杆菌,采用15位点VNTR方法进行基因分型,用BioNumerics 5.0软件对结果进行聚类分析.结果 15个VNTR位点中,MIRU26和Mtub21(HGI=0.827)多态性较高,ETRC(HGI=0.165)和ETRB(HGI=0.292)多态性较差;15位点VNTR分型方法的HGI指数为0.998.经BioNumberics5.0软件聚类分析,可将检测到的78个基因型分为8个基因群(Ⅰ群～Ⅷ群),各群所含基因型分别为Ⅰ群7个,占8.97％;Ⅱ群8个,占10.26％;Ⅲ群43个,占55.13％;Ⅳ群5个,占6.41％;V群2个,占2.56％;Ⅵ群7个,占8.97％;Ⅶ群4个,占5.13％;Ⅷ群2个,占2.56％.结论 仙居县流行的结核分枝杆菌VNTR基因存在明显多态性,至少有8个VNTR基因群,主要流行群为Ⅲ群.

关键词：结核分枝杆菌、基因分型、数目可变串联重复序列、聚类分析

所属期刊栏目：25

分类号：R378.91+1(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

在线出版日期：2015-05-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：866-869