柯萨奇病毒A6型的分子鉴定及VP1区序列分析

摘要：

目的 对2012年-2013年宁波鄞州地区柯萨奇病毒A6型(CA6)进行分子鉴定,并对其VP1部分序列进化分析.方法 RT-PCR对2012年-2013年手足口病人的标本进行病原检测;兼并引物222-292对部分CA6阳性标本VP1部分序列进行扩增、克隆和测序;经过BLAST比对确定病毒的基因型;通过Mega 4.0对VP1序列的差异进行同源性分析.结果 2012年-2013年,共检出CA6阳性230份,占非EV71和非CA16肠道病毒阳性病例的61.8％(230/372).测序结果表明,CA6核酸检测阳性的标本所获得的序列均为CA6型,且VP1区核苷酸序列具有高度一致性,与周边国家或地区CA6的核苷酸同源性为94.3％ ～99.1％.结论 兼并引物222-292对CA6有良好的基因扩增特异性;2012年-2013年宁波市鄞州区手足口病的病原除EV71和CA16外,CA6也是重要的病原.

关键词：手足口病、柯萨奇病毒A组6型、VP1基因、序列分析

所属期刊栏目：24

分类号：R373.2+3(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：宁波市鄞州区科技局第二批科技计划项目鄞科”2012”90号

在线出版日期：2015-01-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：3572-3574